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ICS 65.020.01 B 16 GB 中华人民共和国国家标准 GB/T 28063—2011 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法 Detection and identification of bean pod mottle virus 2011-12-30发布 2012-06-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布 中国国家标准化管理委员会 GB/T 28063—2011 前言 本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草。 本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口。 本标准起草单位:中华人民共和国厦门出人境检验检疫局、中华人民共和国福建出人境检验检疫局 中华人民共和国深圳出人境检验检疫局。 本标准主要起草人:廖富荣、沈建国、郑耘、陈青、林石明、陈红运、黄蓬英、吴媛。 I GB/T28063—2011 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法 1范围 本标准适用于可能携带该病毒的豆科作物的种子、苗木等植物繁殖材料的检测鉴定,也适用于传播 该病毒介体昆虫的检测鉴定。 2菜豆荚斑驳病毒基本信息 中文名:菜豆荚斑驳病毒。 英文名:beanpodmottlevirus。 异名:beanpodmottlecomovirus(菜豆荚斑驳病毒),podmottlevirus(荚斑驳病毒),desmodium virus(金钱草病毒)。 英文缩写:BPMV。 属豇豆花叶病毒科Comoviridae、豇豆花叶病毒属Comouirus。 菜豆夹斑驳病毒的其他信息参见附录A。 3方法原理 利用基于抗原抗体反应的双抗夹心酶联免疫吸附测定(DAS-ELISA)、反转录和体外DNA扩增技 术的反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行检测鉴定。 4主要仪器设备 本标准的检测鉴定方法主要使用以下仪器设备: 微量榨汁机、酶标仪、洗板机、微量天平(感量:0.001g)、PCR仪、荧光PCR仪、电泳仪、水平电泳 槽、凝胶成像仪、高速冷冻台式离心机、水浴槽、pH计和各种量程的可调移液器(1000L、200L、 100 μL、20 μL、2 μL)。 5检测样品的制备 5.1DAS-ELISA和IC-RT-PCR检测样品的制备 对每批送检样品进行症状检查,优先选取具有褐色或黑色斑驳症状的种子(从种脐开始),或者选取 具有斑驳、皱缩、褪绿等症状的叶片 种子样品:称取0.5g~1.0g的种皮作为检测样品,在液氮中充分研磨,回温后按1:10比例加人 样品提取缓冲液继续研磨。 叶片样品:称取0.5g1.0g的叶片作为检测样品,在研钵中研磨或在液氮中研磨,按1:10比例 加入样品提取缓冲液继续研磨。 把研磨后的样品转移到5mL离心管中,8000r/min离心5min,上清液作为DAS-ELISA(见附 录B)和IC-RT-PCR(见附录C)检测提取液。 注:提取液在3h内使用,否则保存在4℃中。 1 GB/T28063—2011 5.2RT-PCR检测样品的制备 称取表现症状的0.1g叶片、种子等样品在液氮中充分研磨后,利用TRIzol方法提取RNA。(见 附录D中的D.3) 检测与鉴定 6 6.1检测鉴定流程 通常,初筛时采用DAS-ELISA检测方法。当DAS-ELISA产生阳性结果时,再采用IC-RT-PCR 或RT-PCR等方法进行验证。 当首先采用IC-RT-PCR或RT-PCR方法检测时,如果产生阳性结果,则通过实时荧光RT-PCR方 法或序列测定等方法验证。 6.2DAS-ELISA检测 把制备的样品上清液加入已包被BPMV抗体的在96微孔板中,进行DAS-ELISA检测,每个样品 平行加到两个孔中。用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照,用样品提 取缓冲液作空白对照,其中阴性对照种类和材料(如:种子或叶片)应该尽量与所检测样品相一致。 具体操作过程见附录B。 6.3RT-PCR检测 分别提取样品和对照的总RNA,反转录合成cDNA后,进行PCR扩增。用健康的植物组织作阴性 对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照,用超纯水作空白对照。 具体操作过程见附录D。 6.4IC-RT-PCR检测 把制备的样品上清液加入已包被BPMV抗体的离心管中,然后进行RT-PCR扩增。用健康的植 物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照,用超纯水作空白对照。 具体操作过程见附录C。 6.5序列测定 将PCR产物回收后,进行克隆、测序,或者直接测序,测序可由生物公司完成。把测序所得到的核 苷酸序列翻译成氨基酸后与已知的BPMV相应序列进行比对,如果与已知的BPMV相应序列同源性 天于75%则判定为BPMV序列,同源性小于75%则判定为非BPMV序列 注:序列比对可利用NCBI网站上的BLAST软件进行,网址为http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ 7结果判定与报告 7.1结果判定 当产生以下检测结果时,则判定为检出BPMV: 判定为检出BPMV; 2 GB/T 28063—2011 当IC-RT-PCR或RT-PCR检测结果呈阳性,测定的序列为BPMV序列时,则判定为检出 BPMV。 7. 2 结果记录与保存 记录各项实验数据,包括样品种类、来源,检测时间、地点、方法和结果等。DAS-ELISA检测结果 保存吸光值的数据报告,IC-RT-PCR或RT-PCR检测结果保存电泳照片,序列测定结果保存测序报 告图。 3
GB-T 28063-2011 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法
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